Vimos como la nueva versión de Blender nos sugería realizar una serie de pruebas para conocer las bondades del modo de renderizado no fotorealista (NPR) denominado Freestyle.
La versión 2.72 incorpora la posibilidad de realizar un desenfoque de la imagen en el entorno de un punto dado.
Podemos realizar una nueva interpretación del Bosque de neuronas Freestyle incorporando esta nueva e interesante funcionalidad.
La nueva versión de Blender nos sugiere realizar una serie de pruebas para conocer las bondades del modo de renderizado no fotorealista (NPR) denominado Freestyle.
Un bosque de neuronas puede ser un ejemplo orgánico de interés para tratar de reordenar una imagen compleja con los contornos que aporta este método de generación de imagen.
Dos clips de vídeo realizadas por Karl Deisseroth y Kwanghun Chung, de la Universidad de Stanford.
El primero muestra un paseo por el cerebro intacto de un ratón, usando una técnica de proyección de imagen fluorescente en un cerebro completo que antes sólo se podían realizar en un cerebro seccionado en rodajas finas.
La segunda muestra es una vista en 3D de cubo de memoria en un cerebro de ratón, o hipocampo, compuesto de diferentes tipos de células:
Las células de Purkinje son un tipo de neurona se encuentra en la corteza cerebelosa en la base del cerebro.
Tienen numerosas espinas sobre sus dendritas que forman un árbol muy ramificado.
Tienen un alto valor anatómico. En la imagen adjunta se presenta una célula obtenida en la base de datos Neuromorpho, y corresponde en particular a una rata tratada en el laboratoio de Martone. Para la repreentación se han utilizado dos colores que han permitido establecer una rampa de color que puede ser asociada a características anatómicas, morfológicas, del arbol dendrítico.
Desde estas páginas quiero felicitar el trabajo de los investigadores de las diferentes disciplinas, y en particular, a los que participan en el proyecto Cajal BlueBrain desde diferentes organismos como el Instituto Cajal o universidades como la UPM ( que coordina el proyecto y aporta su centro de supercomputación CesViMa para la simulación en su super ordenador Margerit), la URJC(responsabilizándose de desarrollar sistemas de visualización avanzados) , y Castilla-La Mancha.
Las impresoras 3D son cada vez más comunes en entornos universitarios, industriales y científicos. Progresivamente se incorporaran a otros de tipo doméstico para convertirse en un elemento más de nuestras cajas de herramientas.
Estas herramientas permiten realizar modelos 3D a partir de un fichero de datos que describe la geometría. Normalmente serán utilizadas para realizar piezas u objetos mecánicos o simples prototipos rápidos.
En este caso os presento los resultados de la utilización de esta técnica para elaborar reproducciones 3D del soma de una neurona, que pueden servir para que los neurocientíficos las estudien morfológicamente.
Tras la conferencia Innovation & Neuroscience: Innovación en la ciencia: qué nos hace ser humanosimpartida por el profesor Javier DeFelipe en el Centro de Innovación BBVA el 18 de octubre, se realizó una pequeña entrevista que se ha editado con imágenes del evento.
Javier refuerza la idea de la necesidad del reconocimiento de imagen y posproceso gráfico en el avance de la ciencia.
Javier DeFelipe nos ha dejado absortos durante cerca de 80 minutos con una interesante charla, dentro del ciclo de conferencias sobre innovación que celebra el BBVA.
Enlazo esta entrada para guardar este mágico momento en el que una de las personas más versadas en la actualidad en este campo, nos ha ofrecido una parte de su tiempo con una magistral oratoria.
Imagen de una neurona, vCH-cobalt, de un moscardón (“Blowfly”) hembra, situada en su lóbulo visual, que ha sido tratada con un software de visualización de neuronas que permite segmentar el modelo en función de diferentes parámetros.
En este caso concreto, se ha coloreado la neurona destacando la variación del diámetro de los elementos filiformes que la componen (axón y dendritas).
Un nuevo renderizado del modelo 3D del cerebro realizado con el software de animación Blender.
En este caso se han definido superficies con material “Glossy” y se ha utilizado un shader (render) con el nuevo modelo denominado “Cycles” que utiliza una técnica de varias pasadas de renderizado con transporte de luz.
El proyecto “Human Connectome Project” ha sido concebido para investigar la conectividad del cerebro humano, es decir, cómo se conectan las diferentes áreas cerebrales formando los circuitos que nos hacen sentir y razonar.
Uno de los objetivos es poder trazar un atlas de las conexiones cerebrales, lo que permitiría analizar su desarrolo y funcionamiento.
